La relación entre los Goya y el cine gay / LGTB no empezó precisamente con buen pie. Estos premios se inauguraron en 1987 y dejaron a La ley del deseo, brillante y arriesgado film LGTB de Pedro Almodóvar, sin una sola nominación. Desde entonces, algún que otro premio a ido a parar a películas que tratan el tema gay / LGTB de pasada, pero en general las películas que más se han adentrado en esta temática han sido dejadas de lado, siendo representativo el caso de Reinas, que, pese a ser estrenada el mismo año en que se aprobó el matrimonio gay en España, no obtuvo ninguna candidatura. Quizá el hecho más doloroso sea la derrota de Krámpack en mejor guión adaptado, aunque, en defensa de los Goya, España tampoco se ha caracterizado precisamente por la calidad de sus películas gays.
1993
-Fresa y chocolate, de Tomás Gutiérrez Alea y Juan Carlos Tabío: 1 premio (película extranjera de habla hispana)
1999
-Todo sobre mi madre, de Pedro Almodóvar: 7 premios (película, director actriz – Cecilia Roth, música, dirección de producción, montaje y sonido) y 7 nominaciones (guión original, actriz secundaria – Candela Peña, actriz revelación – Antonia San Juan, fotografía, dirección artística, vestuario y maquillaje & peluquería)
2000
-Krámpack, de Cesc Guy: 3 nominaciones (director novel, actor revelación - Jordi Vilches y guión adaptado)
-Plata quemada, de Marcelo Piñeyro: 1 premio (película extranjera de habla hispana)
-Plata quemada, de Marcelo Piñeyro: 1 premio (película extranjera de habla hispana)
2003
-A mi madre le gustan las mujeres, de Inés París y Daniela Fejerman: 3 nominaciones (actriz - Leonor Waitling, director novel y música original)
2004
-La mala educación, de Pedro Almodóvar: 4 nominaciones (película, director, dirección de producción y dirección artística)
2006
-AzulOscuroCasiNegro, de Daniel Sánchez-Arévalo: 3 premios (actor secundario – Antonio de la Torre, director novel y actor revelación – Quim Gutiérrez) y 3 nominaciones (actriz – Marta Etura, guión original y canción – “Imaginarte”)
2007
-XXY, de Lucía Puenzo: 1 premio (película extranjera de habla hispana)
2007
-XXY, de Lucía Puenzo: 1 premio (película extranjera de habla hispana)
2010
-Una habitación en Roma, de Julio Medem: 4 nominaciones (actriz – Elena Anaya [papel homosexual], actriz – Natasha Yarovenko [papel homosexual], guión adaptado y canción – “Loving strangers”.
2013
-Los amantes pasajeros, de Pedro Almodóvar: 1 nominación (mejor vestuario).
2013
-Los amantes pasajeros, de Pedro Almodóvar: 1 nominación (mejor vestuario).